Осуществление государственного ветеринарного надзора.

Основными задачами Агентства являются:
- Организация проведения на территории Сахалинской области мероприятий по предупреждению и ликвидации болезней животных.
- Защита населения от болезней, общих для человека и животных, за исключением вопросов, решение которых отнесено к ведению Российской Федерации.
- Обеспечение безопасности продуктов животноводства в ветеринарно-санитарном отношении.
- Организация процесса воспроизводства племенных животных для улучшения продуктивных качеств сельскохозяйственных животных и разведения высокопродуктивных сельскохозяйственных животных.
- Осуществление регионального государственного надзора за соблюдением требований законодательства о ветеринарии и государственного надзора за соблюдением требований законодательства о племенном животноводстве Российской Федерации.